Neofunkcjonalizacja

W wyniku procesu neofunkcjonalizacji po duplikacji jeden gen zachowuje pierwotną funkcję, a drugi ulega mutacjom, w wyniku których zaczyna pełnić nową funkcję
Wedle części badaczy na skutek neofunkcjonalizacji powstało białko kationowe eozynofilów
Neurotoksyna eozynofilów, z której powstało ECP

Neofunkcjonalizacja – jeden z dwóch mechanizmów nabywania nowych funkcji przez geny po duplikacji polegający na tym, że jeden z genów zachowuje swoją oryginalną funkcję, a drugi w wyniku mutacji zaczyna pełnić nową funkcję.

Duplikacja to mechanizm powodujący pojawienie się w genomie dodatkowej kopii już istniejącego genu. W efekcie w haploidalnym genomie istnieje więcej niż pojedyncza kopia danego genu. Takie geny paralogiczne[1] na początku pełnią tę samą funkcję. Może się jednak zdarzyć, że w jednym (i tylko w jednym z nich) zajdą mutacje, które umożliwią mu pełnienie innej funkcji. W tym samym czasie druga kopia genu będzie zachowywała ancestralną (pierwotną) formę, zapewniając wykonywanie funkcji wcześniej już pełnionej przez gen. W stosunku do tej kopii działał będzie dobór oczyszczający przeciwdziałający zmutowanym formom genu, natomiast dzięki zapewnieniu przez tę kopię pierwotnej funkcjonalności druga kopia może ewoluować i nabywać nowe funkcje[2].

Zduplikowane geny mogą oczywiście podlegać także innym procesom. Istnieje przykładowo znaczne prawdopodobieństwo, że zamiast nabycia nowej funkcji mutacje spowodują, że zmieniająca się kopia genu straci tę, którą uprzednio posiadała. Jest to częsty proces, w wyniku którego gen staje się pseudogenem[2].

Geny powstałe przez duplikacje tworzą zwykle rodziny – grupy genów o wspólnym pochodzeniu, pełniące różne, ale w pewien sposób zbliżone funkcje[1].

Proces neofunkcjonalizacji opisany został przez Susumo Ohno w 1970[2]. Innym procesem nabywania przez geny nowych funkcji jest subfunkcjonalizacja[3].

Wedle Futuymy za przykład neofunkcjonalizacji uznaje się powstanie eozynofilowego białka kationowego (ECP). Kodujący je gen zalicza się do rodziny rybonukleaz, podobnie jak gen kodujący eozynofilową neurotoksynę (EDN). Otóż w przeszłości istniał jedynie gen EDN, który w pewnym momencie uległ duplikacji. Liczne niesynonimiczne mutacje obserwuje się jedynie w jednej kopii tego genu, drugą więc musiał utrzymać w niezmienionym stanie dobór. Dzięki rzeczonym podstawieniom białko ECP nabyło własności antypatogenowych[4] (wydzielane jest podczas odpowiedzi immunologicznej[5]). Inne badania, potwierdzając wspólne pochodzenie obu genów, które rozdzieliły się w czasie rozejścia się linii ewolucyjnych małp szerokonosych i wąskonosych, wskazują na szybką ewolucję obu genów i nabycie przez nich obu funkcji związanych z obroną przez infekcjami[6][7].

Przypisy

  1. a b Futuyma 2008 ↓, s. 473.
  2. a b c Futuyma 2008 ↓, s. 477.
  3. Futuyma 2008 ↓, s. 478.
  4. Futuyma 2008 ↓, s. 477–478.
  5. E Boix i inni, Identification and characterization of human eosinophil cationic protein by an epitope-specific antibody, „J Leukoc Biol.”, 69 (6), 2001, s. 1027–35, PMID11404391 [dostęp 2019-08-22] (ang.).
  6. Helene F. Rosenberg i inni, Rapid evolution of a unique family of primate ribonuclease genes., „Nature Genetics”, 10 (2), 1995, s. 219–23, DOI10.1038/ng0695-219, PMID7663519 (ang.).
  7. Helene F. Rosenberg, RNase A ribonucleases and host defense: an evolving story, „J Leukoc Biol.”, 83 (5), 2008, s. 1079–87, DOI10.1189/jlb.1107725, PMID18211964, PMCIDPMC2692241 [dostęp 2019-08-22] (ang.).

Bibliografia

  • Douglas J. Futuyma: Ewolucja. Warszawa: Wydawnictwa Uniwersytetu Warszawskiego, 2008. ISBN 978-83-235-0577-8.

Media użyte na tej stronie

Protein RNASE2 PDB 1gqv.png
Autor: Emw, Licencja: CC BY-SA 3.0
Structure of the RNASE2 protein. Based on PyMOL rendering of PDB 1gqv.
Neofunctionalization after a gene duplication event.png
Autor: Jennonita, Licencja: CC BY-SA 3.0
Neofunctionalization is the process by which a gene acquires a new function after a gene duplication event. The figure shows that once a gene duplication event has occurred one gene copy retains the original ancestral function (represented by the green paralog), while the other acquires mutations that allow it to diverge and develop a new function (represented by the blue paralog).
PDB 1dyt EBI.jpg
Cartoon representation of the molecular structure of protein registered with 1dyt code.